To drugi tom opowieści o słynnym naukowcu i wychowawcy Ambrożym Kleksie. Tym razem pan Kleks odwiedza Krainę o nazwie Bajdocja zamieszkaną przez Bajarzy, którzy zajmują się spisywaniem bajek. Okazuje się, że w Bajdocji zabrakło Atramentu i Wielki Bajarz prosi o pomoc Pana Kleksa. Wyprawa ratunkowa wypływa na poszukiwania Atramentu na statku Apolinary Mruk. Podróżnicy odwiedzają fantastyczne wyspy i krainy Abecję, Patentonie, Wyspy Gramatyczne, Parzybocję, przeżywając niezwykłe przygody.